Diagnostická endoskopie horní části trávicího traktu (esofagogastroduodenoskopie), vč. využití bioptických odběrů pro histologii, cytologii, dále chromodiagnostika, detekce H. pylori atd.
Terapeutická endoskopie v horní části trávicí trubice zahrnuje především: různé metody zástavy jak varikózního, tak nevarikózního krvácení, léčbu stenos jícnu, tj. pneumatická dilatace, dilatace bužiemi, léčba achalázie, zavádění kovových samoexpandibilních stentů, polypektomii, argonovou plasmovou koagulaci,metody k zajištění výživy enterální cestou, tj. zavedení nasoenterální sondy nebo založení perkutánní endoskopické gastrostomie
Koloskopie: diagnostické vyšetření s odběry bioptického materiálu, polypektomie v rektu a tlustém střevě, ošetřování krvácení v dolní části traktu, pracoviště je zapojeno do Národního programu prevence kolorektální rakoviny, jsou prováděna vyšetření pro pozitivní testy na skryté krvácení do stolice s následnými léčebnými a dispenzárními programy
Enteroskopie: slouží k vyšetření orální části tenkého střeva, za dosah standardní esofagogastroduodenoskopie, odběr biopsií, možnost i terapeutického zásahu při zjištění zdroje krvácení,
Kapslová enteroskopie: je nové zcela neinvazivní vyšetření trávicí trubice zaměřené na diagnostiku patologií tenkého střeva, umožňuje prohlédnutí celého průběhu tenkého střeva, doplňuje škálu standardních endoskopických metod
Endoskopická retrográdní cholangiopankreatikografie (ERCP): se provádí na vlastním rtg sále pod skiaskopickou kontrolou, kromě diagnostických možností je využívána široká škála terapeutických metod pro patologie v oblasti žlučových cest, pankreatu a Vaterovy papily
Endosonografie: horní i dolní části trávicí trubice, které lze provádět přístroji jak s radiální tak s lineární sondou, možnost provedení aspirační biopsie tenkou jehlou (FNAB)
Transabdominální ultrasonografie: screeningová či kontrolní vyšetření, možnost punkce tenkou jehnou pod USG kontrolou či založení perkutánní drenáže
Funkční vyšetření trávicího traktu: 24-hodinová pH-metrie, jícnová manometrie, anální manometrie
